Le workshop pluridisciplinaire SeqBio 2015 s’est déroulé à l’Université Paris-Sud à Orsay le 26 et 27 novembre 2015.
Il réunit les communautés d’informatique et de bioinformatique travaillant sur les méthodes d’analyses des textes et les biologistes, génomiciens intéressés par la bioinformatique de séquences.
Grâce au financement des GdR CNRS BIM et IM, d’Inria Saclay, du LIX, de l’I2BC et du LRI, la participation est entièrement gratuite, mais obligatoire pour des raisons de capacité limitée. Le programme comprend des exposés sélectionnés sur soumission et des exposés invités.
Les thèmes abordés à SeqBio vont de la combinatoire et de l’algorithmique du texte à leurs applications à l’analyse bio-informatique des séquences biologiques. Cela inclut les sujets suivants, sans y être limité :
- algorithmique du texte
- structures d’indexation
- combinatoire et statistiques des mots
- algorithmique haute performance ou parallèle
- fouille de textes
- compression
- alignement et recherche de similarité
- recherche, découverte et inférence de motifs ou de répétitions
- analyse des données de séquençage haut-débit (génomique, RNA-seq, Chip-seq, …)
- annotation des génomes, prédiction de gènes
- haplotypes et polymorphismes
- génomique comparative
- signaux de régulation
Éditions précédentes:
- Montpellier, novembre 2014
- Montpellier, novembre 2013
- Marne la Vallée, novembre 2012
- Lille, décembre 2011
- Rennes, janvier 2011
- Montpellier, janvier 2010
- Rouen, septembre 2008
- Marne-la-Vallée, septembre 2007
- Orsay, novembre 2005
- Lille, décembre 2004
- Nantes, mai 2004
- Montpellier, novembre 2003
- Nancy, janvier 2003
- Rouen, juin 2002
- Montpellier, mars 2002
Crédits photos : Ioana Manolescu et les étudiants du master BIBS.